More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2666 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  47.58 
 
 		 1064 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  50.61 
 
 		 1026 aa  770    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2014  DNA polymerase III, alpha subunit  50.64 
 
 		 1096 aa  1028    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202336  normal  0.139953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  46.95 
 
 		 1043 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0102  DNA polymerase III, alpha subunit  50.35 
 
 		 994 aa  823    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  49.94 
 
 		 1026 aa  765    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  48.7 
 
 		 1049 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  44.43 
 
 		 1047 aa  830    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  41.66 
 
 		 1036 aa  739    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0800  error-prone DNA polymerase  44.99 
 
 		 1075 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.338798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  44.32 
 
 		 1072 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  65.58 
 
 		 1077 aa  1077    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2785  DNA polymerase III, alpha subunit  52.83 
 
 		 940 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal  0.619093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  49.94 
 
 		 1026 aa  766    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  48.81 
 
 		 1031 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  44.32 
 
 		 1063 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  44.32 
 
 		 1063 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1532  DNA polymerase III, alpha subunit  42.82 
 
 		 1099 aa  820    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0291245  normal  0.633763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  44.32 
 
 		 1063 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3468  DNA polymerase III, alpha subunit  62.82 
 
 		 1116 aa  1021    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.822294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  49.09 
 
 		 1026 aa  745    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  48.86 
 
 		 1024 aa  722    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  48.69 
 
 		 1031 aa  747    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  47.58 
 
 		 1027 aa  710    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  49.88 
 
 		 1044 aa  758    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4523  error-prone DNA polymerase  43.69 
 
 		 1111 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  52.19 
 
 		 1023 aa  788    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02868  DNA polymerase III alpha chain  45.92 
 
 		 1024 aa  709    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2255  error-prone DNA polymerase  83.33 
 
 		 1175 aa  1954    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  44.32 
 
 		 1072 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4488  error-prone DNA polymerase  44.2 
 
 		 1079 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458186  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4261  DNA polymerase III, alpha subunit  43.54 
 
 		 1128 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  44.6 
 
 		 1025 aa  841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1123  DNA polymerase III, alpha subunit  52.83 
 
 		 940 aa  826    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  50.24 
 
 		 1026 aa  774    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  45.93 
 
 		 1068 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1119  DNA polymerase III, alpha subunit  62.82 
 
 		 1196 aa  848    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0282531  normal  0.883779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1384  DNA polymerase III, alpha subunit  41.39 
 
 		 1193 aa  831    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.38254  hitchhiker  0.00082485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  65.34 
 
 		 1077 aa  1071    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  46.42 
 
 		 1071 aa  699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3998  DNA polymerase III, alpha subunit  52.06 
 
 		 1116 aa  862    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  53.77 
 
 		 1053 aa  830    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  43.68 
 
 		 1049 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  43.09 
 
 		 1040 aa  823    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4896  DNA polymerase III, alpha subunit  49.27 
 
 		 1041 aa  724    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71874  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  45.17 
 
 		 1071 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0445  error-prone DNA polymerase  44.41 
 
 		 1084 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553328  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  53.71 
 
 		 1087 aa  846    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3563  error-prone DNA polymerase  67 
 
 		 1165 aa  1560    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.863163  normal  0.552046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1538  DNA polymerase III, alpha subunit  58.62 
 
 		 1078 aa  914    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  48.8 
 
 		 1082 aa  1001    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  58.1 
 
 		 1097 aa  937    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  42.83 
 
 		 1084 aa  808    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1028  pantoate-beta-alanine ligase  41.28 
 
 		 1029 aa  786    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  46.92 
 
 		 1020 aa  697    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1733  error-prone DNA polymerase  75.19 
 
 		 1112 aa  1711    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647587  hitchhiker  0.00382273 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  50.12 
 
 		 1033 aa  768    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2388  DNA polymerase III, alpha subunit  41.97 
 
 		 1068 aa  741    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3164  DNA polymerase III, alpha subunit  41.58 
 
 		 1195 aa  819    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  44.32 
 
 		 1072 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1903  error-prone DNA polymerase  69.97 
 
 		 1110 aa  1611    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.989909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  55 
 
 		 1059 aa  873    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2666  error-prone DNA polymerase  100 
 
 		 1164 aa  2390    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  55.01 
 
 		 1087 aa  875    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4130  error-prone DNA polymerase  47.24 
 
 		 1153 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  49.3 
 
 		 1039 aa  764    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  49.53 
 
 		 1085 aa  1056    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5094  DNA polymerase III, alpha subunit  53.1 
 
 		 1070 aa  785    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0175  DNA polymerase III, alpha subunit  51.98 
 
 		 1126 aa  859    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4461  DNA polymerase III, alpha subunit  53.1 
 
 		 1117 aa  1143    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2780  DNA polymerase III, alpha subunit  58.48 
 
 		 1092 aa  961    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  45.33 
 
 		 1071 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  54.97 
 
 		 1090 aa  871    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  54.88 
 
 		 1059 aa  871    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  45.05 
 
 		 1109 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2987  error-prone DNA polymerase  73.74 
 
 		 1196 aa  1703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3263  DNA polymerase III, alpha subunit  47.45 
 
 		 1126 aa  1016    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  55.13 
 
 		 1096 aa  850    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  47.62 
 
 		 1076 aa  706    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  46.77 
 
 		 1071 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2100  DNA polymerase III, alpha subunit  43.53 
 
 		 1078 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  45.79 
 
 		 1025 aa  847    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  52.98 
 
 		 1071 aa  806    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  52.74 
 
 		 1075 aa  798    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  56.47 
 
 		 1093 aa  882    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  46.69 
 
 		 1071 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2006  error-prone DNA polymerase  68.72 
 
 		 1195 aa  1402    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  48.86 
 
 		 1031 aa  745    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  45.33 
 
 		 1071 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6832  DNA polymerase III, alpha subunit  47.69 
 
 		 961 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.905572  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  47.32 
 
 		 1049 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  53.49 
 
 		 1049 aa  801    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  44.09 
 
 		 1044 aa  797    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  44.32 
 
 		 1063 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02092  error-prone DNA polymerase  42.03 
 
 		 1083 aa  764    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  48.34 
 
 		 1049 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4291  DNA polymerase III, alpha subunit  51.97 
 
 		 1077 aa  1068    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00038  putative DNA polymerase III alpha chain  44.92 
 
 		 986 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3021  DNA polymerase III, alpha subunit  53.43 
 
 		 1116 aa  841    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1863  DNA-directed DNA polymerase  46.16 
 
 		 1030 aa  703    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0330088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>