More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0494 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0494  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  41.16 
 
 
327 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.26 
 
 
332 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  39.53 
 
 
327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  38.38 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.41 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  38.44 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  38.67 
 
 
326 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.79 
 
 
327 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.14 
 
 
339 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  37.95 
 
 
329 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.8 
 
 
330 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  35.6 
 
 
327 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.13 
 
 
337 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.32 
 
 
358 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.64 
 
 
330 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  41.14 
 
 
336 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.38 
 
 
328 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  36.76 
 
 
322 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  36.09 
 
 
327 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  35.57 
 
 
325 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.18 
 
 
323 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.41 
 
 
334 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  37.13 
 
 
322 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.24 
 
 
328 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.64 
 
 
324 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  36.24 
 
 
339 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.93 
 
 
327 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  38.68 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  38.46 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.17 
 
 
325 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.94 
 
 
328 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.81 
 
 
331 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  37.04 
 
 
322 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.81 
 
 
331 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  37.79 
 
 
330 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.92 
 
 
320 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 
331 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.98 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  39.53 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.62 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  38.39 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.98 
 
 
329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.79 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  37.97 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.3 
 
 
328 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  36.91 
 
 
322 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  37.46 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  36.95 
 
 
338 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  37.97 
 
 
324 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.58 
 
 
328 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.28 
 
 
318 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.45 
 
 
356 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.31 
 
 
321 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.74 
 
 
325 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.58 
 
 
314 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.58 
 
 
328 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4223  extra-cytoplasmic solute receptor  36.82 
 
 
317 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0796335  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  38.31 
 
 
323 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.07 
 
 
336 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  37.46 
 
 
326 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4184  hypothetical protein  38.64 
 
 
331 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.24 
 
 
328 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  38.85 
 
 
325 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.12 
 
 
310 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.43 
 
 
328 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.58 
 
 
335 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.04 
 
 
331 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  39.3 
 
 
327 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  34.9 
 
 
334 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  36.91 
 
 
339 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.96 
 
 
336 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  38.31 
 
 
330 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  34.74 
 
 
325 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  37.88 
 
 
337 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  36.39 
 
 
324 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  39.4 
 
 
340 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  35.81 
 
 
320 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.31 
 
 
333 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.71 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.12 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  36.13 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 
346 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.05 
 
 
324 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  36.43 
 
 
335 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  38.44 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  36.36 
 
 
322 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  36.79 
 
 
339 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  37.78 
 
 
337 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 
398 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.84 
 
 
328 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.36 
 
 
330 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.71 
 
 
334 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  37.5 
 
 
321 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  36.09 
 
 
329 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>