161 genes were found for organism Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pnap_4813  CDS  NC_008759  508  1071  -  564  hypothetical protein  YP_973620  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4814  CDS  NC_008759  1068  2318  -  1251  hypothetical protein  YP_973621  normal  0.856348  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4815  CDS  NC_008759  2427  2984  -  558  hypothetical protein  YP_973622  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4816  CDS  NC_008759  3338  4129  -  792  methionine aminopeptidase, type I  YP_973623  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4817  CDS  NC_008759  4129  4383  -  255  hypothetical protein  YP_973624  normal  0.550337  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4818  CDS  NC_008759  4526  5320  -  795  hypothetical protein  YP_973625  normal  0.843501  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4819  CDS  NC_008759  5435  5764  +  330  transposase (putative)  YP_973626  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4820  CDS  NC_008759  5883  6194  +  312  hypothetical protein  YP_973627  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4821  CDS  NC_008759  6216  6782  +  567  hypothetical protein  YP_973628  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4822  CDS  NC_008759  7040  7771  +  732  hypothetical protein  YP_973629  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4823  CDS  NC_008759  7768  8064  +  297  hypothetical protein  YP_973630  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4824  CDS  NC_008759  8080  8490  +  411  hypothetical protein  YP_973631  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4825  CDS  NC_008759  8463  9788  -  1326  hypothetical protein  YP_973632  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4826  CDS  NC_008759  10686  11291  -  606  hypothetical protein  YP_973633  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4827  CDS  NC_008759  11519  12142  +  624  hypothetical protein  YP_973634  normal  0.592034  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4828  CDS  NC_008759  12347  13003  +  657  hypothetical protein  YP_973635  normal  0.336139  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4829  CDS  NC_008759  13077  13469  +  393  hypothetical protein  YP_973636  normal  0.820465  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4830  CDS  NC_008759  13466  14689  +  1224  hypothetical protein  YP_973637  normal  0.73367  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4831  CDS  NC_008759  15293  16102  -  810  silent information regulator protein Sir2  YP_973638  normal  0.588637  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4832  CDS  NC_008759  16723  17220  -  498  hypothetical protein  YP_973639  normal  0.468957  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4833  CDS  NC_008759  18125  18871  +  747  hypothetical protein  YP_973640  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4834  CDS  NC_008759  18868  19368  +  501  hypothetical protein  YP_973641  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4835  CDS  NC_008759  19365  19685  +  321  hypothetical protein  YP_973642  normal  0.618576  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4836  CDS  NC_008759  19682  19996  +  315  hypothetical protein  YP_973643  normal  0.773683  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4837  CDS  NC_008759  20058  20303  +  246  hypothetical protein  YP_973644  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4838  CDS  NC_008759  20392  20631  +  240  hypothetical protein  YP_973645  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4839  CDS  NC_008759  20637  20846  -  210  hypothetical protein  YP_973646  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4840  CDS  NC_008759  20886  21182  +  297  putative DNA-binding protein  YP_973647  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4841  CDS  NC_008759  21179  21535  +  357  hypothetical protein  YP_973648  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4842  CDS  NC_008759  21728  23065  -  1338  hypothetical protein  YP_973649  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4843  CDS  NC_008759  23547  23921  +  375  hypothetical protein  YP_973650  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4844  CDS  NC_008759  23918  24709  +  792  metallophosphoesterase  YP_973651  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4845  CDS  NC_008759  24757  25020  +  264  hypothetical protein  YP_973652  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4846  CDS  NC_008759  25037  25342  -  306  acylphosphatase  YP_973653  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4847  CDS  NC_008759  25421  25666  +  246  hypothetical protein  YP_973654  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4848  CDS  NC_008759  26218  27315  +  1098  DNA alkylation repair enzyme-like protein  YP_973655  normal  0.868751  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4849  CDS  NC_008759  27545  28195  +  651  XRE family transcriptional regulator  YP_973656  normal  0.593628  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4850  CDS  NC_008759  28519  28791  -  273  hypothetical protein  YP_973657  normal  0.500717  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4851  CDS  NC_008759  28880  29233  -  354  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  YP_973658  normal  0.563845  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4852  CDS  NC_008759  29356  30111  +  756  hypothetical protein  YP_973659  normal  0.384065  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4853  CDS  NC_008759  30119  30565  +  447  signal peptide prediction  YP_973660  normal  0.487428  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4854  CDS  NC_008759  31290  32399  -  1110  hypothetical protein  YP_973661  normal  0.434428  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4855  CDS  NC_008759  32558  33916  +  1359  hypothetical protein  YP_973662  normal  0.874241  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4856  CDS  NC_008759  34250  34507  -  258  hypothetical protein  YP_973663  normal  0.525707  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4857    NC_008759  34563  34822  -  260      normal  0.364062  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4858  CDS  NC_008759  35461  36123  +  663  hypothetical protein  YP_973664  normal  0.332293  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4859  CDS  NC_008759  36413  37345  +  933  cation diffusion facilitator family transporter  YP_973665  normal  0.311707  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4860  CDS  NC_008759  37426  38112  -  687  hypothetical protein  YP_973666  normal  0.261005  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4861  CDS  NC_008759  38152  38619  +  468  hypothetical protein  YP_973667  normal  0.365258  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4862  CDS  NC_008759  38745  39215  +  471  hypothetical protein  YP_973668  normal  0.458414  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4863  CDS  NC_008759  39451  39924  -  474  hypothetical protein  YP_973669  normal  0.342132  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4864  CDS  NC_008759  40277  40531  -  255  hypothetical protein  YP_973670  normal  0.868109  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4865  CDS  NC_008759  41313  41759  +  447  hypothetical protein  YP_973671  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4866  CDS  NC_008759  42101  42526  +  426  hypothetical protein  YP_973672  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4867  CDS  NC_008759  42622  43443  +  822  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_973673  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4868  CDS  NC_008759  43431  44705  -  1275  di-haem cytochrome c peroxidase  YP_973674  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4869  CDS  NC_008759  44702  45538  -  837  hypothetical protein  YP_973675  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4870  CDS  NC_008759  46264  46680  +  417  hypothetical protein  YP_973676  normal  1  normal  0.989359  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4871  CDS  NC_008759  46954  48015  -  1062  HNH nuclease  YP_973677  normal  1  normal  0.98872  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4872  CDS  NC_008759  48020  48421  -  402  histidine triad (HIT) protein  YP_973678  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4873  CDS  NC_008759  48530  49258  -  729  hypothetical protein  YP_973679  normal  0.498095  normal  0.782212  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4874  CDS  NC_008759  49378  50232  -  855  hypothetical protein  YP_973680  normal  1  normal  0.771937  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4875  CDS  NC_008759  50424  50852  -  429  hypothetical protein  YP_973681  normal  1  normal  0.701798  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4876  CDS  NC_008759  51097  52152  +  1056  hypothetical protein  YP_973682  normal  1  normal  0.649455  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4877  CDS  NC_008759  52493  53179  -  687  hypothetical protein  YP_973683  normal  1  normal  0.899225  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4878  CDS  NC_008759  54079  55809  +  1731  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_973684  normal  1  normal  0.983312  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4879  CDS  NC_008759  55817  56092  +  276  hypothetical protein  YP_973685  normal  1  normal  0.811582  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4880  CDS  NC_008759  56142  56549  -  408  hypothetical protein  YP_973686  normal  1  normal  0.842106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4881  CDS  NC_008759  56811  57206  -  396  TfoX domain-containing protein  YP_973687  normal  1  normal  0.834076  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4882  CDS  NC_008759  57338  57604  +  267  hypothetical protein  YP_973688  normal  0.916909  normal  0.993747  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4883  CDS  NC_008759  57852  58097  +  246  hypothetical protein  YP_973689  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4884  CDS  NC_008759  58609  59103  +  495  hypothetical protein  YP_973690  normal  0.569366  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4885  CDS  NC_008759  59235  59714  +  480  hypothetical protein  YP_973691  normal  0.26473  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4886  CDS  NC_008759  60019  60363  +  345  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_973692  normal  0.602991  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4887  CDS  NC_008759  60826  61050  -  225  AbrB family transcriptional regulator  YP_973693  normal  0.510239  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4888  CDS  NC_008759  61259  61846  +  588  hypothetical protein  YP_973694  normal  0.399486  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4889  CDS  NC_008759  61865  62161  +  297  hypothetical protein  YP_973695  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4890  CDS  NC_008759  62249  62722  -  474  XRE family transcriptional regulator  YP_973696  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4891  CDS  NC_008759  62792  64600  -  1809  hypothetical protein  YP_973697  normal  1  normal  0.981822  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4892  CDS  NC_008759  64585  65088  -  504  hypothetical protein  YP_973698  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4893  CDS  NC_008759  65085  66152  -  1068  hypothetical protein  YP_973699  normal  1  normal  0.682902  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4894  CDS  NC_008759  66377  67198  +  822  hypothetical protein  YP_973700  normal  1  normal  0.314192  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4895  CDS  NC_008759  67137  68468  +  1332  hypothetical protein  YP_973701  normal  1  normal  0.275823  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4896  CDS  NC_008759  68478  71603  +  3126  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_973702  normal  0.71874  normal  0.291391  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4897  CDS  NC_008759  72067  73236  -  1170  hypothetical protein  YP_973703  normal  0.285183  normal  0.157342  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4898  CDS  NC_008759  73646  74188  +  543  DNA-directed DNA polymerase  YP_973704  normal  0.560843  normal  0.318536  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4899  CDS  NC_008759  74383  75180  +  798  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_973705  normal  0.835138  normal  0.203553  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4900  CDS  NC_008759  76772  78175  -  1404  hypothetical protein  YP_973706  normal  1  normal  0.32166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4901  CDS  NC_008759  78211  78651  +  441  hypothetical protein  YP_973707  normal  1  normal  0.190047  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4902  CDS  NC_008759  78798  79379  -  582  hypothetical protein  YP_973708  normal  1  normal  0.198658  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4903  CDS  NC_008759  79379  79630  -  252  hypothetical protein  YP_973709  normal  1  normal  0.183124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4904  CDS  NC_008759  79641  80123  -  483  hypothetical protein  YP_973710  normal  1  normal  0.142418  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4905  CDS  NC_008759  80664  82586  +  1923  hypothetical protein  YP_973711  normal  1  normal  0.218952  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4906  CDS  NC_008759  82892  84841  -  1950  pathogenesis-related protein  YP_973712  normal  0.827624  normal  0.119775  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4907  CDS  NC_008759  84838  87147  -  2310  hypothetical protein  YP_973713  normal  0.50635  normal  0.10457  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4908  CDS  NC_008759  87667  87915  +  249  hypothetical protein  YP_973714  normal  0.150667  normal  0.292261  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4909  CDS  NC_008759  88038  88877  -  840  hypothetical protein  YP_973715  normal  0.0665884  normal  0.351144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4910  CDS  NC_008759  89447  91201  +  1755  N-6 DNA methylase  YP_973716  normal  0.268375  normal  0.686666  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4911  CDS  NC_008759  91204  94035  +  2832  hypothetical protein  YP_973717  normal  1  normal  0.453849  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4912  CDS  NC_008759  94028  98260  +  4233  helicase domain-containing protein  YP_973718  normal  0.939232  normal  0.678438  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>