30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4887 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  146  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  45.45 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  36.11 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  34.29 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  38.18 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  49.09 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  49.09 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  32.86 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  40.3 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3961  hypothetical protein  31.58 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0602666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  39.29 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  43.14 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  41.82 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  43.9 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  43.59 
 
 		 96 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>