36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3009 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  158  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  48.57 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  38.36 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  54.76 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  54.76 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  54.76 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  38.57 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  54.76 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  54.76 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  54.76 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  55.88 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  52.94 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  38.03 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  36.71 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  33.8 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0274  putative DNA-binding transcriptional regulator  34 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  36 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  32.39 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0068  AbrB family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.499892  normal  0.748318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3022  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.25 
 
 		 87 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  40.43 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0720  transcriptional regulator, AbrB family  37.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.032212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  38.67 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  45.71 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>