31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3235 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2482  transcriptional regulator, AbrB family  39.51 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1988  transcriptional regulator, AbrB family  38.27 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000759874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0198  transcriptional regulator, AbrB family  36.05 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000131897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  41.56 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  40.26 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  29.67 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  30.77 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  44.23 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  32.94 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  44.64 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0118  transcriptional regulator, AbrB family  46.34 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2499  transcriptional regulator, AbrB family  40.23 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0298673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0183  transcriptional regulator, AbrB family  34.94 
 
 		 180 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1495  transcriptional regulator, AbrB family  32.81 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.370558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0051  transcriptional regulator, AbrB family  43.86 
 
 		 178 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0049  transcriptional regulator, AbrB family  43.86 
 
 		 178 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>