44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0616 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  157  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  39.68 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  39.44 
 
 		 89 aa  57  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  40.91 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  40.3 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3022  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.78 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  40.32 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 128 aa  47.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  41.43 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  39.13 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1710  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0924119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  36.23 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  40.43 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  47.37 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  43.48 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  46.15 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1495  transcriptional regulator, AbrB family  42.55 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.370558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  45.45 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3218  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55751 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  30 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  44.44 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  36.62 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1183  AbrB family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.674203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>