31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5838 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  100 
 
 		 110 aa  225  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  56.44 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  50.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  50.98 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  50 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  49.02 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4012  putative regulator PrlF  46 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399384  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  43.3 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  46 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  38.61 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  36.27 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  36.27 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  36.27 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  36.27 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  36.27 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  36.27 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  37.88 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  32.89 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1183  AbrB family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  45 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  45 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  45 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>