27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4640 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  100 
 
 		 113 aa  221  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  83.19 
 
 		 113 aa  183  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  46.3 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  47.17 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  43.52 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  43.52 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  43.52 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  43.3 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4012  putative regulator PrlF  46.53 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399384  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  45.54 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  32.14 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  32.14 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  32.14 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  32.14 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  32.14 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  32.14 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  39.39 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0845  hypothetical protein  35.14 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4955  hypothetical protein  39.62 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  41.43 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>