28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3609 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  98.2 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  97.3 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  97.3 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4443  HtrA suppressor protein SohA  97.83 
 
 		 46 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.621438 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3426  HtrA suppressor protein SohA  95.65 
 
 		 46 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  39.18 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  39.81 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  39.81 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  34.26 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  38.68 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4012  putative regulator PrlF  41.76 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399384  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  40.86 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  36.27 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  32.14 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  30.36 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  30.85 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  33 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  34.33 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>