25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3006 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  153  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2466  transcriptional regulator, AbrB family  47.95 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0644714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3648  transcriptional regulator, AbrB family  47.95 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  43.9 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  45 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  46.15 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  39.19 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  40.58 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  46.81 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  46.81 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  46.81 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  46.81 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  46.81 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  46.81 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 72 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0393  AbrB family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  43.18 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  42.22 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.36009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  40.48 
 
 		 109 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>