29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2127 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 90 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 92 aa  120  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0819  transcriptional regulator, AbrB family  45.21 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  39.68 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1708  AbrB family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  41.27 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2113  AbrB family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0720  transcriptional regulator, AbrB family  38.46 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.032212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  45 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0393  AbrB family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0127  transcriptional regulator, AbrB family  47.83 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000836565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0959  AbrB family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.538294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0268  AbrB family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 79 aa  42  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000426571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  40 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0277  AbrB family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 79 aa  42  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000039637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0042  transcriptional regulator, AbrB family  41.3 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2441  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.189768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0040  AbrB family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 84 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0507223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0196  AbrB family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 82 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0047  transcription regulator AbrB  41.3 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000208345  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0409  AbrB family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1166  AbrB family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 102 aa  40.8  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000565949  normal  0.132039 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 76 aa  40.8  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0062  AbrB family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0105  transcriptional regulator, AbrB family  43.48 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000445761  unclonable  0.000000000174996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  44.12 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>