50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1697 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  166  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  48.75 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  54.43 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  49.38 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  42.11 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  40.68 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  34.62 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3022  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.44 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  42.11 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27080  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  41.86 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  47.27 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  60 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1976  regulators of stationary/sporulation gene expression  42.11 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  56.25 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  40.85 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2557  transcriptional regulator, AbrB family  32.39 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0068  AbrB family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.499892  normal  0.748318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  39.58 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2131  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  58.97 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>