43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3222 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  163  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  48.81 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3166  AbrB family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  45.45 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0446  transcriptional regulator AbrB  39.51 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627341  normal  0.288224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  42.68 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2561  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.57 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  41.03 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  53.66 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  41.03 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  47.73 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  34.62 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  48.78 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  51.22 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00063  SpoVT / AbrB like domain protein  36.59 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0332656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  40.43 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2133  AbrB family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116838  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  51.22 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  47.5 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1365  hypothetical protein  35.71 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.902317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 94 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  48.72 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  47.37 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  36.73 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  34.69 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 81 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>