28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1521 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 97 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  46.67 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  45.33 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  48.98 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  32.94 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  36 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  38.03 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1616  AbrB family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.345256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1362  hypothetical protein  32.26 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.787025  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1498  transcriptional regulator, AbrB family  32.26 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.794693  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  51.16 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  62.96 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0198  transcriptional regulator, AbrB family  37.04 
 
 		 89 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000131897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  34.18 
 
 		 89 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 81 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2482  transcriptional regulator, AbrB family  37.04 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 80 aa  40.8  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  31.17 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1988  transcriptional regulator, AbrB family  35.19 
 
 		 88 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000759874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>