47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3606 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  100 
 
 		 102 aa  211  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  34.62 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  32.18 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  35.71 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  48.98 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  44.68 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  44.68 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  32.14 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  34.62 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2861  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3983  cell division protein MraZ  34.85 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 75 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  43.75 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  59.26 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0068  AbrB family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.499892  normal  0.748318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1710  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0924119 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0403  cell division protein MraZ  37.31 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1976  regulators of stationary/sporulation gene expression  40.82 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  41.86 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1478  AbrB family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  38.57 
 
 		 85 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2441  transcriptional regulator, AbrB family  34.29 
 
 		 79 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.189768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>