51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1154 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  61.36 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  53.75 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  43.24 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 78 aa  57  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  45.83 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  48.48 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  32.18 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  46.03 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 128 aa  48.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  42.19 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2557  transcriptional regulator, AbrB family  35.21 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3022  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0409  AbrB family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  62.5 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  36.36 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0225  AbrB family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0255  hypothetical protein  44.23 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.701851  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0325  AbrB family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00063  SpoVT / AbrB like domain protein  41.51 
 
 		 82 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0332656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  34.18 
 
 		 97 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 105 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1619  AbrB family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27080  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  39.02 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1365  hypothetical protein  38.6 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.902317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2545  AbrB family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1710  transcriptional regulator, AbrB family  41.67 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0924119 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1976  regulators of stationary/sporulation gene expression  47.5 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1339  AbrB family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0175317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  41.18 
 
 		 73 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>