37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3494 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 81 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  37.04 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  61.36 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  40 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  60.53 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2743  transcriptional regulator, AbrB family  44.9 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.504039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  33.73 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2861  AbrB family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  42.86 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2558  transcriptional regulator, AbrB family  38.46 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  54.05 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  38.33 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  43.55 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11380  transcriptional regulator, AbrB family  39.66 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  42.86 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0868  transcriptional regulator, AbrB family  44.68 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.300001  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2526  transcriptional regulator, AbrB family  37.25 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0134949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3218  transcriptional regulator, AbrB family  47.37 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1535  transcriptional regulator, AbrB family  37.5 
 
 		 68 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0183976  hitchhiker  0.000553685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 76 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2437  transcriptional regulator, AbrB family  36.54 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  38.27 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  38.27 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  40.68 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  48.65 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1402  transcriptional regulator, AbrB family  37.25 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000475988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 82 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>