28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  100 
 
 		 79 aa  154  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  62.12 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  47.14 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  38.78 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  39.13 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  40 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  42.5 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  54.55 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  44.19 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  36.23 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 80 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 79 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1339  AbrB family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0175317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  51.35 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  36 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>