30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0622 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  89.58 
 
 		 96 aa  177  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  30.77 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0198  transcriptional regulator, AbrB family  37.68 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000131897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  44.44 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2482  transcriptional regulator, AbrB family  47.73 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1988  transcriptional regulator, AbrB family  45.45 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000759874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1976  regulators of stationary/sporulation gene expression  45.24 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  45 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  38.78 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0720  transcriptional regulator, AbrB family  58.06 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.032212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  42 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  31.73 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  30.77 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  35.71 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  42.86 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  36.17 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 74 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>