39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3255 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 93 aa  187  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  82.61 
 
 		 94 aa  154  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3166  AbrB family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  44.68 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  38.03 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  44.93 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  38.55 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  32.14 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0720  transcriptional regulator, AbrB family  45.45 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.032212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  62.96 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  56.67 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  31.65 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  29.87 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 128 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4956  transcriptional regulator, AbrB family  37.04 
 
 		 89 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  36.23 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  60 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0446  transcriptional regulator AbrB  36.11 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627341  normal  0.288224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  60.71 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2133  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116838  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  60 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  51.52 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>