21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2044 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  57.53 
 
 		 74 aa  87.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 74 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3166  AbrB family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2561  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  43.66 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3218  transcriptional regulator, AbrB family  31.71 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  42.25 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  37.5 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  33.75 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0446  transcriptional regulator AbrB  33.8 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627341  normal  0.288224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00063  SpoVT / AbrB like domain protein  37.14 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0332656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  45.24 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 81 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  35.21 
 
 		 82 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>