47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2538 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 89 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  54.43 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0446  transcriptional regulator AbrB  42.5 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627341  normal  0.288224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  45.78 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3166  AbrB family transcriptional regulator  44 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  43.9 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  42.47 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  42.37 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  44.64 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2133  AbrB family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116838  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  38.36 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3022  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.78 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  41.38 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  42.62 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  52.27 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0255  hypothetical protein  39.29 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.701851  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0225  AbrB family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1365  hypothetical protein  34.62 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.902317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00063  SpoVT / AbrB like domain protein  38.46 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0332656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3283  hypothetical protein  37.14 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0854112  normal  0.0138905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3218  transcriptional regulator, AbrB family  33.75 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2561  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.54 
 
 		 76 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  33.75 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2131  transcriptional regulator, AbrB family  35.09 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5196  AbrB family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.582752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1478  AbrB family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249769  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  58.62 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0845  AbrB family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.643505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  47.5 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0840  AbrB family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  53.49 
 
 		 105 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 81 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>