20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2738 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 73 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00063  SpoVT / AbrB like domain protein  38.36 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0332656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0407  AbrB family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000503263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1837  transcriptional regulator, AbrB family  37.5 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0746962  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0225  AbrB family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0255  hypothetical protein  48.89 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.701851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1365  hypothetical protein  39.73 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.902317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3283  hypothetical protein  57.89 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0854112  normal  0.0138905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  36.84 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0196  AbrB family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  45.24 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1478  AbrB family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0170  AbrB family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1708  AbrB family transcriptional regulator  45 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  41.18 
 
 		 89 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>