24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3733 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 84 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  46.3 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  46.3 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2716  transcriptional regulator, AbrB family  41.67 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0876689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  63.33 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1431  transcriptional regulator, AbrB family  63.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.401092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  44.44 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  56.67 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  45.24 
 
 		 73 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 94 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0325  AbrB family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  44.23 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0329  AbrB family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.485621  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1535  AbrB family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.0713691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2070  AbrB family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0844554 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0274  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.29 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0118  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 70 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>