25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0560 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  98.89 
 
 		 90 aa  178  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  46.67 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  41.56 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  46.3 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0198  transcriptional regulator, AbrB family  39.51 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000131897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2482  transcriptional regulator, AbrB family  43.1 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1988  transcriptional regulator, AbrB family  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000759874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  37.66 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0196  AbrB family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  44.68 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  31.73 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  60 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0407  AbrB family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000503263  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 72 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  48.65 
 
 		 94 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>