35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0376 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  40.51 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  49.12 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  49.12 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  34.57 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  36.84 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1988  transcriptional regulator, AbrB family  29.51 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000759874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0198  transcriptional regulator, AbrB family  30.65 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000131897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  47.62 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  42.86 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  45 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  47.62 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  40.68 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  40.35 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2482  transcriptional regulator, AbrB family  27.87 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  65.52 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  43.86 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  35.71 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  44 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 79 aa  40  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0720  transcriptional regulator, AbrB family  48.72 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.032212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>