21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0316 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  37.04 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  35.8 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  39.53 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0196  AbrB family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  39.62 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  43.59 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1708  AbrB family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  33.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  35 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  40.82 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0868  transcriptional regulator, AbrB family  51.28 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.300001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2113  AbrB family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  38.16 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0686  AbrB family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129659  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 92 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>