19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3513 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 87 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3166  AbrB family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0446  transcriptional regulator AbrB  46.25 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627341  normal  0.288224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  40.51 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  43.37 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  37.66 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2133  AbrB family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116838  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  38.55 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4673  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  33.93 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2557  transcriptional regulator, AbrB family  54.55 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>