19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2120 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  98.65 
 
 		 74 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3166  AbrB family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 75 aa  97.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2561  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.33 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  41.77 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  40.28 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0446  transcriptional regulator AbrB  36.99 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627341  normal  0.288224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  46.38 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  42.65 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3218  transcriptional regulator, AbrB family  29.27 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55751 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  41.86 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>