24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2557 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2557  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 77 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  35.21 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0877  AbrB family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.282814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  35.21 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  32.39 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  48.84 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2774  transcriptional regulator, AbrB family  46.15 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0267  AbrB family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  45.45 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  30.99 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1495  AbrB family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  42  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.872822  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0216  transcriptional regulator, AbrB family  45.24 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.643498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0595  AbrB family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0068  transcriptional regulator, AbrB family  45.24 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0080  AbrB family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0083  AbrB family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0165891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0133  transcriptional regulator, AbrB family  45.24 
 
 		 180 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000474992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 79 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2499  transcriptional regulator, AbrB family  40 
 
 		 90 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0298673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>