39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1219 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  61.36 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  56.25 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  32.91 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  50.85 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  55 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  35.71 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  41.38 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  35 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  45.24 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2557  transcriptional regulator, AbrB family  30.56 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0068  AbrB family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 84 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.499892  normal  0.748318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  38.64 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0877  AbrB family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.282814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  32.94 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3022  SpoVT/AbrB domain-containing protein  30.99 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2133  AbrB family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116838  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2113  AbrB family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3648  transcriptional regulator, AbrB family  39.47 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2466  transcriptional regulator, AbrB family  39.47 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0644714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  39.47 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>