30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5361 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  42 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  46.53 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  46.53 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  46.6 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  45.79 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  45.26 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  40 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  39.8 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4012  putative regulator PrlF  38.78 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399384  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  37.5 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  47.83 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  35.35 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  33.33 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  33.33 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  40 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  29.07 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  46.67 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>