36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1246 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  92.19 
 
 		 128 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  88.28 
 
 		 128 aa  226  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  81.9 
 
 		 105 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  79.05 
 
 		 105 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  70.48 
 
 		 105 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  67.62 
 
 		 105 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  35.71 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  46.48 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  46.48 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  38.89 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  34.82 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  66.67 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  37.61 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  36.11 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  37.61 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  36.7 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  36.7 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  36.7 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  53.66 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  30.26 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  31.82 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  37.5 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  34.33 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  56.1 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  28.72 
 
 		 93 aa  42  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  35.79 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4012  putative regulator PrlF  32.84 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1708  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  57.14 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>