39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4189 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  207  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  83.81 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  81.9 
 
 		 128 aa  174  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  81.9 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  76.19 
 
 		 105 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  72.38 
 
 		 105 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  67.31 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  47.89 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  47.89 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  44.29 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  36.76 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  41.43 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  32.89 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  38.61 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  30.53 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  51.22 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  38.3 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  56.1 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  60 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  52.5 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  57.5 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  33.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1708  AbrB family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  44.9 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  43.9 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  31.34 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  32.43 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  32.43 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  32.43 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1166  AbrB family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 102 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000565949  normal  0.132039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>