43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  100 
 
 		 85 aa  167  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  62.12 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  46.67 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  39.73 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  41.38 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1339  AbrB family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0175317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  35.62 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2743  transcriptional regulator, AbrB family  42.11 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.504039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  51.28 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  38.16 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  55 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  45 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  36 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  45 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  52.5 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2545  AbrB family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  37.18 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3274  AbrB family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1781  transcriptional regulator, AbrB family  51.43 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.867819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1457  transcriptional regulator, AbrB family  51.43 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.203506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  48.78 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  36.76 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3012  AbrB family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 83 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>