30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0282 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0282  putative regulator PrlF  100 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4640  putative regulator PrlF  83.19 
 
 		 113 aa  183  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03514  HtaR suppressor protein  45.54 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1413  putative regulator PrlF  47.22 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1133  putative regulator PrlF  47.22 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1415  putative regulator PrlF  47.17 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1268  putative regulator PrlF  42.59 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5838  putative regulator PrlF  38.61 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4012  putative regulator PrlF  45.54 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399384  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3730  putative regulator PrlF  44.55 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.538675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5361  AbrB family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0760953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  30.36 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  30.36 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  30.36 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  30.36 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  30.36 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  30.36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0845  hypothetical protein  43.4 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  40 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4955  hypothetical protein  37.25 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  35.94 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>