24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6993 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 81 aa  166  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  92.59 
 
 		 81 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  47.14 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  41.56 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  41.89 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  35.62 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6766  AbrB family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  38.36 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  41.82 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  35.06 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27080  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  47.62 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  43.9 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  31.25 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0068  AbrB family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.499892  normal  0.748318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>