28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1078 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1078  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  169  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  62.96 
 
 		 82 aa  117  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  52.5 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  51.25 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  40.51 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  36.71 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  40.28 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  44.62 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  50.91 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  47.17 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  45.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2557  transcriptional regulator, AbrB family  32.39 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  46.3 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 74 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>