8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4443 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0576  putative regulator PrlF  97.83 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3319  putative regulator PrlF  97.83 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3609  putative regulator PrlF  97.83 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.895472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4443  HtrA suppressor protein SohA  100 
 
 		 46 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.621438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0571  putative regulator PrlF  95.65 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02994  predicted regulator  95.65 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02945  hypothetical protein  95.65 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3426  HtrA suppressor protein SohA  93.48 
 
 		 46 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>