44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4817 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008759  Pnap_4817  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550337  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5755  hypothetical protein  88.1 
 
 
84 aa  155  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0851  hypothetical protein  88.1 
 
 
84 aa  150  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3246  hypothetical protein  66.67 
 
 
86 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3405  hypothetical protein  65.15 
 
 
83 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0934  hypothetical protein  65.15 
 
 
83 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.111998  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3272  hypothetical protein  65.15 
 
 
83 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2145  hypothetical protein  75.41 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.135821  normal  0.0391756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0105  hypothetical protein  67.21 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1619  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1394  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2558  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3194  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2120  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2645  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2505  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1972  hypothetical protein  70.49 
 
 
74 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1124  hypothetical protein  61.11 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00431481  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2157  hypothetical protein  56 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109141  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2486  hypothetical protein  72.41 
 
 
76 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0669  hypothetical protein  61.97 
 
 
99 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1148  hypothetical protein  61.97 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  64.52 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1030  hypothetical protein  62.9 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514521  normal  0.822013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1026  hypothetical protein  62.9 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2361  hypothetical protein  75 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1501  hypothetical protein  54.39 
 
 
72 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5036  hypothetical protein  62.5 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0440839  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0084  hypothetical protein  57.89 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1366  hypothetical protein  51.79 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28580  hypothetical protein  56.36 
 
 
73 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2494  hypothetical protein  56.36 
 
 
73 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.908795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3229  hypothetical protein  45.21 
 
 
74 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3137  hypothetical protein  45.21 
 
 
74 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.835397  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0885  hypothetical protein  45.21 
 
 
74 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.20859  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  46.27 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  44.78 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1179  hypothetical protein  52.63 
 
 
70 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750426  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1660  hypothetical protein  48.39 
 
 
74 aa  62  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.414948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0270  hypothetical protein  50.88 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4591  hypothetical protein  49.12 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140245  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1470  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2322  EGF-like  50 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  38.1 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>