45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3246 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4817  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0851  hypothetical protein  73.85 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5755  hypothetical protein  70.77 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3272  hypothetical protein  63.77 
 
 		 83 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0934  hypothetical protein  63.77 
 
 		 83 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.111998  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3405  hypothetical protein  63.77 
 
 		 83 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0105  hypothetical protein  70.49 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2145  hypothetical protein  72.13 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.135821  normal  0.0391756 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2486  hypothetical protein  75.86 
 
 		 76 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1124  hypothetical protein  69.35 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00431481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  70.97 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1148  hypothetical protein  69.35 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0669  hypothetical protein  69.35 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2558  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2120  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1394  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3194  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2645  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1619  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1026  hypothetical protein  67.74 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1030  hypothetical protein  67.74 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514521  normal  0.822013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2157  hypothetical protein  67.74 
 
 		 77 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109141  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1972  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2505  hypothetical protein  61.54 
 
 		 74 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2361  hypothetical protein  73.08 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5036  hypothetical protein  62.5 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0440839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3229  hypothetical protein  49.32 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0885  hypothetical protein  49.32 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.20859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3137  hypothetical protein  49.32 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.835397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0084  hypothetical protein  55.93 
 
 		 73 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1501  hypothetical protein  52.63 
 
 		 72 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2494  hypothetical protein  58.18 
 
 		 73 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.908795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28580  hypothetical protein  61.82 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1366  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  50.91 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  49.09 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1660  hypothetical protein  60 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.414948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2322  EGF-like  50 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1470  hypothetical protein  57.78 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1179  hypothetical protein  49.12 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750426  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0270  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4591  hypothetical protein  45.61 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  35 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>