46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1026 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1030  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514521  normal  0.822013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1026  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1148  hypothetical protein  87.18 
 
 		 78 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0669  hypothetical protein  87.18 
 
 		 99 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  89.74 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1124  hypothetical protein  83.95 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00431481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2157  hypothetical protein  85.9 
 
 		 77 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109141  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1619  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1394  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2558  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3194  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2120  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2645  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2486  hypothetical protein  82.76 
 
 		 76 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2505  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1972  hypothetical protein  65.28 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0105  hypothetical protein  55.29 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2145  hypothetical protein  68.85 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.135821  normal  0.0391756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3246  hypothetical protein  67.74 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5755  hypothetical protein  62.9 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0851  hypothetical protein  64.52 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4817  hypothetical protein  62.9 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0934  hypothetical protein  59.68 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.111998  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3405  hypothetical protein  59.68 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3272  hypothetical protein  59.68 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2361  hypothetical protein  63.33 
 
 		 76 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.443416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28580  hypothetical protein  58.73 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2494  hypothetical protein  57.14 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.908795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5036  hypothetical protein  58.93 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0440839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1501  hypothetical protein  55.36 
 
 		 72 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1660  hypothetical protein  47.14 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.414948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3229  hypothetical protein  53.57 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3137  hypothetical protein  53.57 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.835397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0885  hypothetical protein  53.57 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.20859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  54.55 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  52.73 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2322  EGF-like  53.85 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1179  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750426  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0084  hypothetical protein  50.94 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1366  hypothetical protein  46.43 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1470  hypothetical protein  44.62 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4591  hypothetical protein  43.94 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0270  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  38.46 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  34.62 
 
 		 73 aa  42  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.604065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>