236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4846 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  100 
 
 
101 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  61.8 
 
 
119 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  55.88 
 
 
102 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  47.31 
 
 
95 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  44.09 
 
 
90 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  44.33 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  44.33 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  43.16 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  44.87 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  48.57 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  45.45 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  47.06 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  45.71 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  44.32 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  40.23 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  39.76 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  46.48 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  41.89 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  40.24 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  43.48 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  43.48 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  41.11 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  43.48 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  40.7 
 
 
252 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  44.44 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  45.65 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  40.91 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  39.74 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  38.2 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1261  acylphosphatase  45.65 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2922  acylphosphatase  45.65 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2235  acylphosphatase  45.65 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  40.91 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1279  acylphosphatase  48.15 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0974  acylphosphatase  48.15 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3047  acylphosphatase  45.65 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  48.44 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  41.89 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  42.17 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  41.67 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  41.77 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  37.21 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  40.85 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  37.5 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  43.33 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  41.43 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  43.48 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  41.49 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  46.48 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  36.11 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  44.44 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  42.86 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  44.59 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  41.67 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0110  acylphosphatase  44.59 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  38.67 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  42.25 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  40.28 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  40.58 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  39.76 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  44.12 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  42.25 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5419  acylphosphatase  39.58 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  36.71 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  42.25 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  42.25 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  42.25 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  43.48 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  39.44 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  43.08 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  39.73 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  37.5 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  40.23 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  37.5 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  38.89 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  37.04 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  36.84 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  42.03 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  41.1 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  42.25 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  37.5 
 
 
90 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4872  acylphosphatase  41.84 
 
 
105 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450612  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  42.03 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  36.49 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  41.79 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  48.44 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  46.03 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  40 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  42.42 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5312  acylphosphatase  39.36 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148968  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5548  acylphosphatase  39.36 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.802692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4724  acylphosphatase  39.36 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  39.24 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  42.42 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0986  acylphosphatase  41.18 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000580623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  42.03 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  39.13 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>