217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1453 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  56.32 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  49.44 
 
 		 92 aa  84.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  47.25 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  47.25 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  51.76 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  51.16 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  54.02 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  43.62 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  49.44 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  48.81 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  52.11 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  52.11 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  52.86 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  41.11 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  41.38 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  45.35 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  39.13 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  43.9 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  43.96 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  44.05 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  45.88 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  49.3 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  44.05 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  46.15 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  47.06 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  42.53 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  44.19 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  44.32 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  50.72 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  48.81 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  45.78 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  43.18 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  44.05 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  43.48 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5419  acylphosphatase  47.89 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  45.68 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  51.43 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  44.87 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  47.89 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  45 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1279  acylphosphatase  47.89 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  42.67 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  42.86 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  43.9 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  40.66 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0974  acylphosphatase  47.89 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1261  acylphosphatase  47.89 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3047  acylphosphatase  47.89 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2922  acylphosphatase  47.89 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2235  acylphosphatase  47.89 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  45.33 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  41.43 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  46.05 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  41.76 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  46.48 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  47.14 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  41.86 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  44.74 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  42.35 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  40.43 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  38.64 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  44.05 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5312  acylphosphatase  45.07 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148968  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4724  acylphosphatase  45.07 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4872  acylphosphatase  50 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5548  acylphosphatase  45.07 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.802692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0110  acylphosphatase  45.07 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  41.38 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  46.75 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  45.71 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  42.39 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  40.66 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  43.06 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  48.72 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  40.26 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  45.45 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  41.18 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  42.35 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  46.58 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  41.77 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  38.1 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  43.18 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  40.66 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  41.18 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  40.48 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  38.46 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  38.16 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  40.66 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  40 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  37.36 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  39.02 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  43.24 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  36.84 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  43.94 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  43.94 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  42.68 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>