234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6189 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  75.82 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  55.88 
 
 
101 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  44.57 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  45.16 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  47.83 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  47.83 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  46.74 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  51.43 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  44.19 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  44.83 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  45.12 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  48.72 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  45.16 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  44.59 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  39.78 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  42.86 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  41.76 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  40 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  44.05 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  42.31 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  44.87 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  43.21 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  45.71 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  42.11 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  47.14 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  41.11 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  38.95 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  44.68 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  47.89 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  41.1 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  41.77 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  40 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  45.95 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  42.5 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  41.25 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  44.78 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  43.24 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  43.84 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  44.44 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  35.23 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  39.77 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  40.45 
 
 
252 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  45.21 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  40.74 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  43.42 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  43.42 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  43.24 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  33.75 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  41.25 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  38.46 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  39.73 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  46.94 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  33.8 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  40 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  46.94 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  39.76 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  40.85 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  43.24 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  37.84 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  41.89 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  40.54 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  39.74 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1279  acylphosphatase  46.94 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  41.1 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  39.24 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0974  acylphosphatase  46.94 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1261  acylphosphatase  46.94 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3047  acylphosphatase  46.94 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2922  acylphosphatase  46.94 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2235  acylphosphatase  46.94 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  44.9 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  38.54 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  35.8 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  46.15 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  40.79 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  35.23 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  39.02 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  37.97 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  40.54 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  40.7 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  40.54 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  36.56 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  35 
 
 
94 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  39.19 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  42.05 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  36.71 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  37.14 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0110  acylphosphatase  44.33 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  41.67 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  35.9 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5419  acylphosphatase  43.88 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  33.73 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  39.24 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  34.57 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4872  acylphosphatase  45 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450612  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  39.44 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>