243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3279 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  100 
 
 		 92 aa  183  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  70 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  56.32 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  55.17 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  55.42 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  54.67 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  54.67 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  53.16 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  56 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  51.16 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  51.16 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  51.16 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  47.5 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  48.75 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  47.5 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  44.71 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  48.42 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  53.33 
 
 		 99 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  52.87 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  41.57 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  53.42 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  46.15 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  41.57 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  45.74 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  50.7 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  50.63 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  48.72 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  47.76 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  50 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  51.39 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  46.75 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  48.65 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  45 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  45.74 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  50.62 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  48 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  50 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  47.3 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  51.32 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  41.67 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  41.86 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  52.24 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  43.53 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  46.25 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  44.62 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  44.62 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  48.57 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  45.83 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  51.79 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  44.62 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  44.19 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  41.67 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  42.05 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  39.77 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  41.67 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  47.76 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  49.3 
 
 		 252 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  50.65 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  51.39 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  52.24 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  44.59 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  31.25 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  50.72 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  47.89 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  47.95 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  42.47 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5419  acylphosphatase  45.07 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  40.85 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  50 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  40.74 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  53.12 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  52.94 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  49.35 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  50.75 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  42.86 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  37.8 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  49.25 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  46.97 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  49.25 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4724  acylphosphatase  42.25 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  39.13 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  43.94 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  46.58 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  45 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5312  acylphosphatase  42.86 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148968  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  43.94 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  49.25 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4872  acylphosphatase  44.29 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5548  acylphosphatase  42.86 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.802692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  44.44 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  40 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  49.35 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  44.83 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  42.47 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  38.89 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  44.74 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  42.17 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  42.42 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  42.42 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>