More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1735 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  100 
 
 
99 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  81.82 
 
 
99 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  59.6 
 
 
99 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  55.56 
 
 
99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  54.08 
 
 
99 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  50.52 
 
 
100 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  53.54 
 
 
99 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  46.94 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  52.17 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  59.42 
 
 
93 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  57.97 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  53.25 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  56.52 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  49.46 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  60.29 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  50.7 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  54.17 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  51.32 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  45.05 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  54.93 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  50 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  54.22 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  52.7 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  48.53 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  61.54 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  43.53 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  46.39 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  53.33 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  53.52 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  51.47 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  46.91 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  46.15 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  44.16 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  49.33 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  40 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  52.17 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  44.74 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  49.28 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  52.7 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  49.28 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  48.68 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  50.75 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  50.75 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  41.43 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  42.05 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  52.17 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  49.33 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  48.53 
 
 
95 aa  67  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  48.53 
 
 
91 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  40.96 
 
 
101 aa  66.6  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  49.23 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  50 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  50.67 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  50.72 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  47.22 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  49.28 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  50.72 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  47.22 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  52.78 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  46.75 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  47.3 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  50.72 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  44.93 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  38.95 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  53.25 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  44.87 
 
 
89 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  40.51 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  46.48 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  47.83 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  46.97 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  41.77 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  51.52 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  41.67 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  43.48 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  47.3 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  48.57 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  45.95 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  53.12 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  51.43 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  41.43 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  40.26 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  47.22 
 
 
252 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  40.79 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  40.91 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  41.3 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  44.29 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  41.3 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  40.91 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  41.77 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  38.95 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  38.95 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  38.95 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>