292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2654 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  53.49 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  56.41 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  55.95 
 
 		 93 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  54.22 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  56.96 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  54.44 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  52.17 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  55.7 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  48.31 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  48.31 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  51.19 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  48.84 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  52.86 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  51.76 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  54.93 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  52.17 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  50 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  48.84 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  50 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  55.22 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  56.52 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  49.49 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  48.24 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  60.29 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  53.62 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  48.15 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  46.99 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  45.68 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  52.44 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  51.47 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  53.62 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  52.86 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  42.05 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  52.86 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  46.07 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  49.43 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  48.19 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  45.78 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  48.57 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  50.65 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  49.3 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  52.94 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  44.09 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  50.75 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  44.57 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  52.94 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  49.32 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  52.94 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  47.22 
 
 		 97 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  45.78 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  47.22 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  47.22 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  50 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  42.68 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  47.83 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  45.95 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  46.84 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  53.97 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  45.65 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  51.47 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  46.38 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  52.17 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  45.95 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  51.43 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  52.94 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  47.3 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  49.25 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  50 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  50.75 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  39.29 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  48.53 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  47.83 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  51.39 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  36.9 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  45.33 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  40 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  45.33 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  40.66 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  50 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  47.83 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  44.58 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  42.5 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  45.33 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  38.27 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  41.03 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  43.75 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  38.2 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  50 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  45.78 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  47.5 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  45.45 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  42.17 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  42.86 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  39.19 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  40.58 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  42.31 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  43.59 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  45 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>