261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3184 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  61.8 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  57.14 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  47.31 
 
 		 101 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  50 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  44.57 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  48.84 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  50 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  48.75 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  53.95 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  58.21 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  48.84 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  55.07 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  55.71 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  47.56 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  57.81 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  47.56 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  56 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  54.67 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  55.88 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  47.73 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  45.12 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  52 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  50 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  52.11 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  52 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  45.71 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  40.24 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  46.67 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  49.33 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  45.68 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  51.35 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  37.36 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  41.46 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  40.91 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  40.74 
 
 		 91 aa  67  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  38.16 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  45.68 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  49.33 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  55.38 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  42.5 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  41.24 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  45.33 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  44.32 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  53.12 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  49.25 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  42.86 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  45.68 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  50 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  40.24 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  45.12 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  44.19 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  46.34 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  39.53 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  43.94 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  50.7 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  53.12 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  44 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  38.37 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  51.43 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  43.94 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  47.83 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  37.21 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  47.89 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  41.33 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  42.05 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  52.38 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  47.3 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  44.3 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  42.86 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  43.48 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  40.51 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  42.19 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  43.06 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  42 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  46.43 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  41.3 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  37.8 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  41.33 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  53.12 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  46.27 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  41.3 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  37.65 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  45.95 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  38.96 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  40 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  35.37 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  44.78 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  47.69 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  42.39 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  43.04 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0969  acylphosphatase  41.18 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000144451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  40.28 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  36.67 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  45.12 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  37.97 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  39.51 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  44.93 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  43.42 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>